Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms