Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms