Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms