Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms