Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MttpO08601 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MttpO08601 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MttpO08601 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MttpO08601 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MttpO08601 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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