Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BC117090L7N257 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC117090L7N257 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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