Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer2J3QPU5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms