Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20795J3QP49 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20795J3QP49 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms