Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20918J3QN17 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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