Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3415J3QMS8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Gm3415J3QMS8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm3415J3QMS8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3415J3QMS8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm3415J3QMS8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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