Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms