Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r34G3XA52 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms