Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3tc1G3X9F6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3tc1G3X9F6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms