Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zkscan2G3X952 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan2G3X952 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms