Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim55G3X8Y1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms