Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm44G3UW88 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm44G3UW88 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms