Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp72F8VQC1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms