Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm42421F6X8D5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms