Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod3E9QA62 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms