Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms