Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srsf11E9Q6E5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms