Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms