Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm17727E9Q4V7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17727E9Q4V7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17727E9Q4V7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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