Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc71lE9Q4T4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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