Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms