Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms