Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pdzd2E9Q1M1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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