Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf11E9PZM7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf11E9PZM7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms