Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl3lE9PWZ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl3lE9PWZ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl3lE9PWZ3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms