Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms