Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930444G20RikD3Z741 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444G20RikD3Z741 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms