Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930467E23RikD3Z1P8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930467E23RikD3Z1P8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms