Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms