Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc170D3YXL0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms