Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrnnD3YUU6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrnnD3YUU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms