Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms