Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms