Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpruB1AUH1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpruB1AUH1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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