Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn8B1ARD8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms