Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CatsperbA2RTF1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms