Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Htra4A2RT60 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms