Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf2A2AT37 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms