Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms