Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms