Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp8nlA2ABX0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms