Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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