Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Col5a3Q9JLI2 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Col5a3Q9JLI2 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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