Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SrpraQ9DBG7 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms