Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc18Q640L5 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms