Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms